在新材料的研發過程中，全自動掃描電鏡可以實時觀察材料的微觀結構變化，幫助研究人員優化制備工藝和參數，提高材料的性能和質量。例如，在鋰電池正極材料的研究中，通過掃描電鏡可以觀察正極材料的顆粒形狀、尺寸分布以及表面包覆情況，分析其對電池性能的影響，從而指導生產工藝的改進。在產品質量控制方面，可以快速檢測材料表面的缺陷、雜質以及微觀結構的均勻性，確保產品符合質量標準。
在生物醫學研究中可用于觀察生物樣本的微觀形態和結構，如研究細胞的形態變化、細胞間的相互作用、生物膜的結構以及藥物對細胞的影響等。例如，在藥物研發過程中，可以通過掃描電鏡觀察藥物與細胞作用后的細胞表面形態變化，評估藥物的療效和安全性。同時，還可以對生物組織工程中的支架材料進行表征，了解其微觀結構和孔隙率對細胞生長和分化的影響，為組織修復和再生提供理論依據。
全自動掃描電鏡的主要優勢特點：
1.高分辨率成像：能夠提供納米級甚至更高分辨率的圖像，清晰地顯示樣品的微觀形貌和結構細節，如材料的晶粒形狀、尺寸分布、表面粗糙度、孔隙結構以及生物樣本的細胞形態、組織架構等，有助于深入理解樣品的物理和化學性質。
2.自動化程度高：從樣品的預處理、加載到圖像采集和分析，整個過程可以實現高度自動化，無需人工長時間值守和頻繁操作，不僅提高了工作效率，還降低了操作人員的勞動強度和技能要求，使得非專業人員也能夠相對容易地使用設備進行基本的檢測和分析。
3.多功能觀察能力：除了常規的形貌觀察外，還可以配備各種附件和分析模塊，實現對樣品成分、晶體結構、元素分布等多種信息的同步分析。例如，結合能譜儀(EDS)可以進行元素的定性和定量分析，確定樣品中各種元素的種類和含量；配備電子背散射衍射系統(EBSD)則能夠分析材料的晶體結構和晶體取向，為材料研究提供更全面的信息。
4.廣泛的應用領域：在材料科學領域，可用于研究金屬材料、陶瓷材料、高分子材料、納米材料等的微觀結構、性能演變以及失效機理；在生物學領域，能夠觀察細胞、細菌、病毒等生物樣本的形態、結構和表面特征，以及生物材料與組織之間的相互作用；在地質學方面，可對礦物、巖石、土壤等樣品進行分析，了解其成分、結構和形成過程；此外，在電子工業、化工、能源、環境科學等諸多領域也有重要的應用價值。
